Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms