Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms