Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a1Q05722 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms