Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox13Q04891 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms