Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms