Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms