Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms