Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms