Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd1Q04519 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms