Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RelaQ04207 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RelaQ04207 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RelaQ04207 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms