Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnb1Q03717 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms