Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms