Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms