Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nucb1Q02819 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms