Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nhlh1Q02576 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms