Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Zfp39Q02525 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms