Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ank1Q02357 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ank1Q02357 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms