Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snai1Q02085 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms