Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RykQ01887 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RykQ01887 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RykQ01887 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RykQ01887 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms