Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hoxd1Q01822 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms