Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms