Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms