Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gjb2Q00977 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms