Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf2raQ00941 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf2raQ00941 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf2raQ00941 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf2raQ00941 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf2raQ00941 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf2raQ00941 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms