Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms