Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms