Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F8a1Q00558 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms