Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms