Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PgrQ00175 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms