Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VldlrP98156 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VldlrP98156 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms