Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc1P98083 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shc1P98083 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms