Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms