Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms