Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nbr1P97432 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms