Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmsP97355 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmsP97355 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmsP97355 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmsP97355 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmsP97355 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SmsP97355 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmsP97355 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms