Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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