Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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