Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3f3aP84244 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3f3aP84244 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3f3aP84244 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3f3aP84244 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3f3aP84244 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3f3aP84244 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3f3aP84244 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H3f3aP84244 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3f3aP84244 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3f3aP84244 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H3f3aP84244 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms