Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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