Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ErfP70459 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ErfP70459 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ErfP70459 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ErfP70459 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ErfP70459 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ErfP70459 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ErfP70459 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ErfP70459 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ErfP70459 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms