Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad1P70340 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smad1P70340 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms