Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprvP70289 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprvP70289 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprvP70289 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprvP70289 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprvP70289 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprvP70289 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprvP70289 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprvP70289 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprvP70289 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprvP70289 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprvP70289 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprvP70289 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprvP70289 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprvP70289 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprvP70289 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprvP70289 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprvP70289 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprvP70289 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprvP70289 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms