Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms