Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgdrP70263 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms