Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms