Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms