Protein–RNA interactions for Protein: P70160

Calca, Calcitonin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcaP70160 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CalcaP70160 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CalcaP70160 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CalcaP70160 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CalcaP70160 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CalcaP70160 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CalcaP70160 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CalcaP70160 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CalcaP70160 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CalcaP70160 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms