Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba1cP68373 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba1cP68373 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms