Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms