Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rps17P63276 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms